被封印的太阳神殿是游戏主线的开端，此处为不可操作的纯剧情场景，全程无需手动操作，连续按下决定键即可推进剧情。这段剧情中，费因的黑剑士艾克蒙德为复活爱人，以永生的诅咒和对爱人的全部记忆为代价，与夜之王格瑞斯特签订了致命契约，为后续所有主线剧情埋下伏笔。
剧情推进至七年后的艾索雷王城，国王与大臣正在召开例行会议时，王城突然遭到袭击。此时玩家将操控入侵者羽人祭祀帕修丝汀，上前与王城卫兵接触即可触发战斗，消灭卫兵后，与公主、国王、王后中任意一人对话，就会触发元老骑士救驾剧情。后续会接连发生两场强制战斗，帕修丝汀自身能力较强，正常操作下很难失败。护卫骑士救走公主后，玩家可自由行动，调查王座旁的暗道即可触发下一步主线剧情。
护卫骑士带着公主慌不择路逃进了亡灵出没的维安特森林，从这里开始，游戏正式进入可操作阶段，初始可控角色为护卫骑士克里格尔和游侠射手玛格莉忒。进入森林后，会触发与两个骷髅兵的强制战斗，这场战斗难度较低，合理运用基础攻击即可轻松取胜。主线剧情的触发点在森林东北边小桥前拦路的石碑，调查石碑后可进入地下墓室，最大的石碑即为墓室入口，进入后需挑战第一个BOSS巫妖，进入墓室门的密码为356。击败巫妖后，会获得战利品废品武士刀森罗云海，虽看似无用且无人能装备，但切记不要丢弃，后续有重要用途。此外，墓地左上区域有增加速度的武器短弓，建议收集，错过后难以补得。击败巫妖并调查完毕后，拦路的石碑会消失，过桥北上即可抵达森林小镇。
抵达森林小镇后，克里格尔与玛格莉忒得知北上的道路被落石封住，清理落石需等到次日，两人决定先在小镇休息一天。小镇内有商店可进行物资补给，重点注意克里格尔携带的礼仪剑不要卖掉，后续有锻造用途。与小镇左方民居里睡着的小女孩对话，可触发后续山洞遇见小仙灵的分支事件，建议触发，能获得实用道具。前往小镇东部农场，与农民交谈后得知，农场右边几天前多出来一间屋子，两人进入屋子后，结识精灵理魔道士依芙琳，交谈完毕后上床睡觉，此时视点会切换到同在维安特森林的黑剑士艾克蒙德——因失去部分重要记忆，他此时化名阿格姆特。
视点切换后，玩家将操控阿格姆特身处维安特森林的精灵废墟，他在此处与国王特使接头，身为铁狼佣兵团团长的阿格姆特拒绝了特使的任务。随后他察觉到废墟中有魔力波动，决定前往一探究竟，与魔法阵前的女性对话后触发剧情，恶魔出现并引发强制战斗，这场战斗难度不高，阿格姆特HP较低时可使用技能“意志”回复血量，正常情况下不会失败。剧情完结后，视点切回森林小镇的克里格尔队，从农车回镇子时，会与一杏艾索雷士兵发生战斗，击败士兵后，之前被落石封住的北边山路已清理完毕，可继续北上推进主线。
北上进入艾加斯峡谷与艾加斯高地，若此前已与民居里的小女孩对话，那么峡谷入口左边的小山洞里会出现小仙灵，抓住小仙灵后，给她一株万灵草，可换得HP上限+50的道具，提升角色生存能力。进入艾加斯高地矿洞二层，击败BOSS食人魔后，会发现道路被堵死，调查地上的一封信得知，要通过矿洞需从高地南边的民居绕道，顺着绳梯爬上可快速返回洞口，一直往南走即可到达阿格姆特家院庭。该区域有大量草药和矿石，建议尽量多收集，至少要拿一个水晶石，后续锻造和任务中会用到。
抵达阿格姆特家后，进入卧室壁橱可获得复活药水和“装炸药的口袋”，“装炸药的口袋”是后续进入66后院的必备道具，务必收好。进入地下室，调查完闪光的日记后，可通过房间内的传送法阵离开，沿路行进可抵达耳语海岸。耳语海岸为过渡通路，此处的怪物难度有所提升，若角色等级不足或装备较差，不要硬撑，可先返回之前的区域刷级、补给，再继续推进。从耳语海岸往北进入山洞，有石头的岔路暂时无需理会，从山洞北边出去即可到达自由港多利安。
自由港多利安是重要的补给站点，这里的商店货物种类齐全，可好好整理角色装备、补充物资。进入武器商店，会遇到一位老铁匠，他可以用克里格尔携带的礼仪剑锻造成一把实用的突刺剑，锻造所需材料为：礼仪剑×1、铁矿石×12、秘银×4、水晶×5、砥石×1，材料集齐后即可锻造，锻造成功后老铁匠会要求签名，记得收好签名道具。出武器商店后，与旅店旁边的小乞丐对话，会触发额外小剧情，最后可获得能在隐藏商店购买物品的信物，不要丢失。精品商店墙上有一个画着六芒星图案的贴纸，调查后依芙琳可习得魔法冰晶术，提升魔法输出能力。旅店出售一些食物（不能在战斗时使用），可适当准备一些，尤其是辣椒油，后续有一定用途。在港务局与书记员对话后，被告知没有前往法兰蒂斯的船，需找海盗帮忙，此时前往码头区的深水酒馆4号房间，寻找海盗加弗里菲洛，克里格尔因过往恩怨控制不住自己，与加弗里菲洛闹翻。离开酒馆后，三人返回在旅店预定的2号房间，在此遭到艾索雷密探的袭击，这场战斗为必败战斗，无需浪费物资抵抗，随后会被住在隔壁的阿格姆特所救。剧情过后，视点切换至阿格姆特，先与水晶球前的帕修丝驮话，再与醒来的凯尔薇丝琳对话，阿格姆特会要求凯尔薇丝琳与克里格尔等人同行前往法兰蒂斯，之后操控阿格姆特前往港务局购买船票，视点切回克里格尔队。
克里格尔队乘船抵达法兰蒂斯，在港口检查时被扣押，后一步下船的凯尔薇丝琳觉得不该扔下众人不管，决定去找同是铁狼佣兵团的艾弗莱克帮忙。从大地图港口出去往东边走，进入费恩山道，视点切换到凯尔薇丝琳队，开始推进救援剧情。进入费恩山道后，初期无需理会周围的山洞，往东边走过桥后切换地图，即可到达艾弗莱克家。为制作劫狱用的炸药，需要先收集硫磺，此时艾弗莱克加入队伍（艾弗莱克不参与最终战，无需大力培养），从最靠近入口的那个山洞进去，开始寻找硫磺。
进入山洞后，扳下两个开关形成新通路，通路外侧有“开关的拉杆”，后续有一个机关需要用到这个拉杆，记得拾取。山洞三层有回复之泉的区域，左侧过桥的洞口出去，外面有一个隐藏入口，可自行探索，能获得一些额外物资。同样在这个山洞，有绳梯的地方下侧洞口出去，可拿到打开BOSS房门的道具，拿到道具后，顺着绳梯爬上，前往挑战BOSS。击败BOSS后，可获得硫磺，艾弗莱克同时获得召唤土元素技能，提升队伍战斗力。该区域有大量洞穴菇（草药）和矿石，可顺便收集。重点注意，BOSS房间进去之前的场景，地上有解除森罗云海封印的咒文碎片，非常好找，务必拾取，这是解锁森罗云海真身的关键物品之一。收集完硫磺和关键道具后，出BOSS房间，艾弗莱克用返回之石将两人传送回家里，视点切换到已经抵达罗萨兰正教国的阿格姆特队。
阿格姆特队抵达北风港后，重点探索北风港的道具商店，商店内有隐藏房间，踩一下地图最左下角的地板（颜色与周围不同），就会出现暗门。若持有之前从老铁匠那里获得的信物，可在隐藏商店购买特殊物品，购买完毕后，信物即失去用途，可随意处理。隐藏商店右边的火盆里有道具，记得调查拾取。在北风港整理好装备、补给物资后，即可前往位于北风港东南的羽人遗迹（在一个无法进入的小镇南边），推进主线剧情。
进入羽人遗迹后，需注意阿格姆特因处于诅咒状态，无法获取经验值，因此无需在此处刻意刷级，重点推进剧情即可。遗迹内的水火甬道难度不高，按正常路线行进即可，里世界的甬道需要先调查完整张地图上的5个脏器，才能形成新的道路，耐心探索即可找到所有脏器。进入仪式之间后，先与帕修丝驮话，再调查上方的魔晶球，即可触发关键剧情。帕修丝汀为了用阿格姆特手里的剑完成召唤恶魔的仪式，欺骗了阿格姆特，随后触发两场强制战斗。第一场战斗为阿格姆特对战火恶魔依弗里特，依弗里特会变身一次，刚从虚空中返回的它，变身后无法自由控制火焰，难度不算太高；第二场战斗为阿格姆特对战帕修丝汀，帕修丝汀可被正常击倒，若想节省时间，可等待阿格姆特HP低于一半时，触发记忆部分恢复的事件，此时帕修丝汀会发动偷袭，阿格姆特会用终结技镇魂将其秒杀。剧情过后，阿格姆特抛弃了佩剑背德之刃，职业由费因的黑剑士转变为剑圣，等级会有所下降，视点切换至凯尔薇丝琳与艾弗莱克的劫狱二人组。
劫狱二人组从艾弗莱克家出发，原路返回大地图，大地图北边不远处即为费恩城堡，这里是关押克里格尔与依芙琳的地方，也是当前主线的核心目标。抵达费恩城堡后，两人利用之前收集的硫磺制作的炸药，炸开监狱大门，成功救出克里格尔和依芙琳，但得知玛格莉忒公主已被押解回艾索雷王城。撤离过程中，会遭遇大批巡逻士兵，凯尔薇丝琳为掩护同伴，决定独自断后，克里格尔等人无奈只能先撤离，后续再寻找机会营救凯尔薇丝琳。
撤离后，克里格尔、依芙琳与艾弗莱克前往艾弗莱克的家中暂避，克里格尔和依芙琳坚持要回去营救凯尔薇丝琳，但艾弗莱克以任务为重，阻止了他们，并讲述了自己的过往：曾是流浪儿的他与姐姐相依为命，姐姐不知所踪后，被铁狼佣兵团前任团长贝尔斯南收养，贝尔斯南在宫廷斗争中为保护佣兵团而牺牲，临终前将团长之位传给阿格姆特，这段经历让艾弗莱克将团队的存续看得高于一切。三人休整完毕后，为追寻玛格莉忒公主的下落，前往博恩的都樊镇。
抵达都樊镇后，从一个绿发醉酒剑士口中得知，有一位女孩被绑架至帕米尔高塔，容貌与玛格莉忒相似，三人立即前往帕米尔高塔。赶到塔顶后，发现一名黑暗司教正控制着曾在多利安海港见过的占卜师，黑暗司教自称正为主人收集一种名为“法鲁达”的负能量，目的是向人类复仇。击败黑暗司教后，占卜师告知众人，这名司教是由羽人魔化而成，进一步揭示了背后的阴谋。需要注意，若此时依芙琳尚未获得转职道具“魔导士之袍”，可在都樊镇帮小女孩写作业，作业答案为12113，满分后即可获得“魔导士之袍”，该事件必须在完成帕米尔高塔剧情之前完成，错过则无法补得。
离开帕米尔高塔后，三人前往布鲁茨要塞，在要塞内的一间旅馆中，意外与艾克蒙德和加弗里菲洛重逢，此时两人已经成功救出了玛格莉忒公主。原来，加弗里菲洛在途中截下了押送公主的马车，并通知艾克蒙德前来支援，顺利救出了公主。艾克蒙德制止了仍想去救凯尔薇丝琳的克里格尔，明确指出他当前的首要任务是护送公主去见大贤者安西姆，寻找对抗幕后黑手的方法。与此同时，被控制的艾索雷国王向暗魔法师禀报，公主被人救走，但搜出了公主的手链，被俘的凯尔薇丝琳也被押送至艾索雷王宫，暗魔法师为进行邪恶实验，将大量“法鲁达”注入凯尔薇丝琳体内，使她异化成了失去心智的怪物“女妖”。
众人汇合后，决定借道法兰蒂斯公国，前往精灵之森寻找大贤者安西姆。抵达精灵之森的银月村时，发现这里已是尸横遍野，显然遭遇了袭击。前往安西姆的炼金室，发现大贤者正被女妖和艾索雷将军奥弗罗围攻，众人立即加入战斗，击败奥弗罗后，女妖选择撤退。奥弗罗在临死前透露，艾索雷国王早已被怪物取代，并将宝石“维纳利斯”交还给了玛格莉忒公主。随后，安西姆向众人揭示了惊人的真相：“法鲁达”源于远古的魔神战争，当时主神米修拉为消灭恶魔，以整个羽人部族为代价发动了至高神力，极致的圣光在消灭魔龙的同时，也产生了与之相对的暗能量“法鲁达”，少量羽人外逃，战后米修拉将剩余的羽人与残存的“法鲁达”一同封印，而暗魔法师的目的，就是收集“法鲁达”和作为钥匙的“维纳利斯”，以复活魔龙。
真相大白后，艾克蒙德独自动身，追寻正在举行邪恶仪式的暗魔法师，途中得知了更为震撼的消息——暗魔法师竟声称自己是艾克蒙德的父亲。与此同时，玛格莉忒、克里格尔等人则前往北地三岛，寻找能对抗魔龙的神器“圣弓·玛鲁狄”，这是击败魔龙的关键道具。乘船前往北地三岛的途中，遭遇风暴，克里格尔不慎落水，被冲到艾尔斯岛岸边，被一名神秘女性救起，随后发现这名女性竟是自己早已死去、又被黑魔法复活的姐姐艾黎。艾黎坦白，她不愿与弟弟为敌，决定背叛暗魔法师，并指引众人前往遗忘之塔寻找圣弓·玛鲁狄。
众人抵达遗忘之塔后，在塔顶见到了圣弓·玛鲁狄，但被律神米拉拒绝授予。失望之际，异化后的凯尔薇丝琳（女妖）追杀而至，众人不敌惨败，危急时刻，艾黎发动禁忌魔法，与女妖同归于尽，克里格尔悲痛欲绝。众人事后在塔外发现了凯尔薇丝琳的首饰，才惊觉那被消灭的女妖正是她异化后的形态。众人悲痛之余，返回艾尔斯岛村长家，意外发现了圣弓·玛鲁狄，玛格莉忒将“维纳利斯”宝石与圣弓结合，成功解放了神器的力量，此时众人终于拥有了对抗魔龙的实力。
解放圣弓力量后，众人前往暗魔法师举行仪式的地点，与艾克蒙德汇合，此时暗魔法师的仪式已接近尾声，魔龙即将复活。众人联手与暗魔法师展开最终决战，击败暗魔法师后，魔龙成功复活，迎来游戏的最终BOSS战。战斗前，需做好充分准备，克里格尔可使用之前在66后院学到的RP技能“命运之击”（1/4的几率造成极大伤害，是唯一可以瞬杀最终BOSS的技能），依芙琳装备解锁真身的森罗云海（攻击力138，INT30点，属性优异），玛格莉忒装备圣弓·玛鲁狄，发挥神器的最大威力。最终BOSS战难度较高，需合理分配角色技能，及时补给血量，利用各角色的优势配合作战，击败魔龙后，即可完成主线剧情，解锁游戏结局。
补充主线流程中的关键要点，避免玩家错过重要内容：克里格尔的转职道具“信仰徽章”，需在教会捐献超过10000G后获得；玛格莉忒无需额外获取转职道具，15级以上且装备圣弓·玛鲁狄后，会自动触发转职剧情；依芙琳的转职道具“魔导士之袍”有3次获取机会，除了都樊镇帮小女孩写作业外，BOSS石魔像有15%几率掉落，麦狄亚大沙漠发掘也可获得；艾弗莱克的转职道具“圣者之书”，击败BOSS海龙后必定掉落。森罗云海的另一张封印解除咒文，在通向多利安东南面归隐者之塔的宝箱里，归隐者之塔的进入方法为：进入多利安之前的山洞，找到被石块堵住的岔路，剧情获得艾克蒙德家的返回之石后（艾弗莱克在队伍中），艾弗莱克会用炸药炸掉挡路的石头，进入后可让依芙琳学会武士刀的使用方法，才能装备森罗云海。EG地图“66后院”若错过精灵之森的进入机会，后期在造物者遗迹里找黑暗精灵对话也可进入，但有3分钟时间限制，建议在此期间全部购买经验之书，提升队伍等级。
剧情推进至七年后的艾索雷王城，国王与大臣正在召开例行会议时，王城突然遭到袭击。此时玩家将操控入侵者羽人祭祀帕修丝汀，上前与王城卫兵接触即可触发战斗，消灭卫兵后，与公主、国王、王后中任意一人对话，就会触发元老骑士救驾剧情。后续会接连发生两场强制战斗，帕修丝汀自身能力较强，正常操作下很难失败。护卫骑士救走公主后，玩家可自由行动，调查王座旁的暗道即可触发下一步主线剧情。
护卫骑士带着公主慌不择路逃进了亡灵出没的维安特森林，从这里开始，游戏正式进入可操作阶段，初始可控角色为护卫骑士克里格尔和游侠射手玛格莉忒。进入森林后，会触发与两个骷髅兵的强制战斗，这场战斗难度较低，合理运用基础攻击即可轻松取胜。主线剧情的触发点在森林东北边小桥前拦路的石碑，调查石碑后可进入地下墓室，最大的石碑即为墓室入口，进入后需挑战第一个BOSS巫妖，进入墓室门的密码为356。击败巫妖后，会获得战利品废品武士刀森罗云海，虽看似无用且无人能装备，但切记不要丢弃，后续有重要用途。此外，墓地左上区域有增加速度的武器短弓，建议收集，错过后难以补得。击败巫妖并调查完毕后，拦路的石碑会消失，过桥北上即可抵达森林小镇。
抵达森林小镇后，克里格尔与玛格莉忒得知北上的道路被落石封住，清理落石需等到次日，两人决定先在小镇休息一天。小镇内有商店可进行物资补给，重点注意克里格尔携带的礼仪剑不要卖掉，后续有锻造用途。与小镇左方民居里睡着的小女孩对话，可触发后续山洞遇见小仙灵的分支事件，建议触发，能获得实用道具。前往小镇东部农场，与农民交谈后得知，农场右边几天前多出来一间屋子，两人进入屋子后，结识精灵理魔道士依芙琳，交谈完毕后上床睡觉，此时视点会切换到同在维安特森林的黑剑士艾克蒙德——因失去部分重要记忆，他此时化名阿格姆特。
视点切换后，玩家将操控阿格姆特身处维安特森林的精灵废墟，他在此处与国王特使接头，身为铁狼佣兵团团长的阿格姆特拒绝了特使的任务。随后他察觉到废墟中有魔力波动，决定前往一探究竟，与魔法阵前的女性对话后触发剧情，恶魔出现并引发强制战斗，这场战斗难度不高，阿格姆特HP较低时可使用技能“意志”回复血量，正常情况下不会失败。剧情完结后，视点切回森林小镇的克里格尔队，从农车回镇子时，会与一杏艾索雷士兵发生战斗，击败士兵后，之前被落石封住的北边山路已清理完毕，可继续北上推进主线。
北上进入艾加斯峡谷与艾加斯高地，若此前已与民居里的小女孩对话，那么峡谷入口左边的小山洞里会出现小仙灵，抓住小仙灵后，给她一株万灵草，可换得HP上限+50的道具，提升角色生存能力。进入艾加斯高地矿洞二层，击败BOSS食人魔后，会发现道路被堵死，调查地上的一封信得知，要通过矿洞需从高地南边的民居绕道，顺着绳梯爬上可快速返回洞口，一直往南走即可到达阿格姆特家院庭。该区域有大量草药和矿石，建议尽量多收集，至少要拿一个水晶石，后续锻造和任务中会用到。
抵达阿格姆特家后，进入卧室壁橱可获得复活药水和“装炸药的口袋”，“装炸药的口袋”是后续进入66后院的必备道具，务必收好。进入地下室，调查完闪光的日记后，可通过房间内的传送法阵离开，沿路行进可抵达耳语海岸。耳语海岸为过渡通路，此处的怪物难度有所提升，若角色等级不足或装备较差，不要硬撑，可先返回之前的区域刷级、补给，再继续推进。从耳语海岸往北进入山洞，有石头的岔路暂时无需理会，从山洞北边出去即可到达自由港多利安。
自由港多利安是重要的补给站点，这里的商店货物种类齐全，可好好整理角色装备、补充物资。进入武器商店，会遇到一位老铁匠，他可以用克里格尔携带的礼仪剑锻造成一把实用的突刺剑，锻造所需材料为：礼仪剑×1、铁矿石×12、秘银×4、水晶×5、砥石×1，材料集齐后即可锻造，锻造成功后老铁匠会要求签名，记得收好签名道具。出武器商店后，与旅店旁边的小乞丐对话，会触发额外小剧情，最后可获得能在隐藏商店购买物品的信物，不要丢失。精品商店墙上有一个画着六芒星图案的贴纸，调查后依芙琳可习得魔法冰晶术，提升魔法输出能力。旅店出售一些食物（不能在战斗时使用），可适当准备一些，尤其是辣椒油，后续有一定用途。在港务局与书记员对话后，被告知没有前往法兰蒂斯的船，需找海盗帮忙，此时前往码头区的深水酒馆4号房间，寻找海盗加弗里菲洛，克里格尔因过往恩怨控制不住自己，与加弗里菲洛闹翻。离开酒馆后，三人返回在旅店预定的2号房间，在此遭到艾索雷密探的袭击，这场战斗为必败战斗，无需浪费物资抵抗，随后会被住在隔壁的阿格姆特所救。剧情过后，视点切换至阿格姆特，先与水晶球前的帕修丝驮话，再与醒来的凯尔薇丝琳对话，阿格姆特会要求凯尔薇丝琳与克里格尔等人同行前往法兰蒂斯，之后操控阿格姆特前往港务局购买船票，视点切回克里格尔队。
克里格尔队乘船抵达法兰蒂斯，在港口检查时被扣押，后一步下船的凯尔薇丝琳觉得不该扔下众人不管，决定去找同是铁狼佣兵团的艾弗莱克帮忙。从大地图港口出去往东边走，进入费恩山道，视点切换到凯尔薇丝琳队，开始推进救援剧情。进入费恩山道后，初期无需理会周围的山洞，往东边走过桥后切换地图，即可到达艾弗莱克家。为制作劫狱用的炸药，需要先收集硫磺，此时艾弗莱克加入队伍（艾弗莱克不参与最终战，无需大力培养），从最靠近入口的那个山洞进去，开始寻找硫磺。
进入山洞后，扳下两个开关形成新通路，通路外侧有“开关的拉杆”，后续有一个机关需要用到这个拉杆，记得拾取。山洞三层有回复之泉的区域，左侧过桥的洞口出去，外面有一个隐藏入口，可自行探索，能获得一些额外物资。同样在这个山洞，有绳梯的地方下侧洞口出去，可拿到打开BOSS房门的道具，拿到道具后，顺着绳梯爬上，前往挑战BOSS。击败BOSS后，可获得硫磺，艾弗莱克同时获得召唤土元素技能，提升队伍战斗力。该区域有大量洞穴菇（草药）和矿石，可顺便收集。重点注意，BOSS房间进去之前的场景，地上有解除森罗云海封印的咒文碎片，非常好找，务必拾取，这是解锁森罗云海真身的关键物品之一。收集完硫磺和关键道具后，出BOSS房间，艾弗莱克用返回之石将两人传送回家里，视点切换到已经抵达罗萨兰正教国的阿格姆特队。
阿格姆特队抵达北风港后，重点探索北风港的道具商店，商店内有隐藏房间，踩一下地图最左下角的地板（颜色与周围不同），就会出现暗门。若持有之前从老铁匠那里获得的信物，可在隐藏商店购买特殊物品，购买完毕后，信物即失去用途，可随意处理。隐藏商店右边的火盆里有道具，记得调查拾取。在北风港整理好装备、补给物资后，即可前往位于北风港东南的羽人遗迹（在一个无法进入的小镇南边），推进主线剧情。
进入羽人遗迹后，需注意阿格姆特因处于诅咒状态，无法获取经验值，因此无需在此处刻意刷级，重点推进剧情即可。遗迹内的水火甬道难度不高，按正常路线行进即可，里世界的甬道需要先调查完整张地图上的5个脏器，才能形成新的道路，耐心探索即可找到所有脏器。进入仪式之间后，先与帕修丝驮话，再调查上方的魔晶球，即可触发关键剧情。帕修丝汀为了用阿格姆特手里的剑完成召唤恶魔的仪式，欺骗了阿格姆特，随后触发两场强制战斗。第一场战斗为阿格姆特对战火恶魔依弗里特，依弗里特会变身一次，刚从虚空中返回的它，变身后无法自由控制火焰，难度不算太高；第二场战斗为阿格姆特对战帕修丝汀，帕修丝汀可被正常击倒，若想节省时间，可等待阿格姆特HP低于一半时，触发记忆部分恢复的事件，此时帕修丝汀会发动偷袭，阿格姆特会用终结技镇魂将其秒杀。剧情过后，阿格姆特抛弃了佩剑背德之刃，职业由费因的黑剑士转变为剑圣，等级会有所下降，视点切换至凯尔薇丝琳与艾弗莱克的劫狱二人组。
劫狱二人组从艾弗莱克家出发，原路返回大地图，大地图北边不远处即为费恩城堡，这里是关押克里格尔与依芙琳的地方，也是当前主线的核心目标。抵达费恩城堡后，两人利用之前收集的硫磺制作的炸药，炸开监狱大门，成功救出克里格尔和依芙琳，但得知玛格莉忒公主已被押解回艾索雷王城。撤离过程中，会遭遇大批巡逻士兵，凯尔薇丝琳为掩护同伴，决定独自断后，克里格尔等人无奈只能先撤离，后续再寻找机会营救凯尔薇丝琳。
撤离后，克里格尔、依芙琳与艾弗莱克前往艾弗莱克的家中暂避，克里格尔和依芙琳坚持要回去营救凯尔薇丝琳，但艾弗莱克以任务为重，阻止了他们，并讲述了自己的过往：曾是流浪儿的他与姐姐相依为命，姐姐不知所踪后，被铁狼佣兵团前任团长贝尔斯南收养，贝尔斯南在宫廷斗争中为保护佣兵团而牺牲，临终前将团长之位传给阿格姆特，这段经历让艾弗莱克将团队的存续看得高于一切。三人休整完毕后，为追寻玛格莉忒公主的下落，前往博恩的都樊镇。
抵达都樊镇后，从一个绿发醉酒剑士口中得知，有一位女孩被绑架至帕米尔高塔，容貌与玛格莉忒相似，三人立即前往帕米尔高塔。赶到塔顶后，发现一名黑暗司教正控制着曾在多利安海港见过的占卜师，黑暗司教自称正为主人收集一种名为“法鲁达”的负能量，目的是向人类复仇。击败黑暗司教后，占卜师告知众人，这名司教是由羽人魔化而成，进一步揭示了背后的阴谋。需要注意，若此时依芙琳尚未获得转职道具“魔导士之袍”，可在都樊镇帮小女孩写作业，作业答案为12113，满分后即可获得“魔导士之袍”，该事件必须在完成帕米尔高塔剧情之前完成，错过则无法补得。
离开帕米尔高塔后，三人前往布鲁茨要塞，在要塞内的一间旅馆中，意外与艾克蒙德和加弗里菲洛重逢，此时两人已经成功救出了玛格莉忒公主。原来，加弗里菲洛在途中截下了押送公主的马车，并通知艾克蒙德前来支援，顺利救出了公主。艾克蒙德制止了仍想去救凯尔薇丝琳的克里格尔，明确指出他当前的首要任务是护送公主去见大贤者安西姆，寻找对抗幕后黑手的方法。与此同时，被控制的艾索雷国王向暗魔法师禀报，公主被人救走，但搜出了公主的手链，被俘的凯尔薇丝琳也被押送至艾索雷王宫，暗魔法师为进行邪恶实验，将大量“法鲁达”注入凯尔薇丝琳体内，使她异化成了失去心智的怪物“女妖”。
众人汇合后，决定借道法兰蒂斯公国，前往精灵之森寻找大贤者安西姆。抵达精灵之森的银月村时，发现这里已是尸横遍野，显然遭遇了袭击。前往安西姆的炼金室，发现大贤者正被女妖和艾索雷将军奥弗罗围攻，众人立即加入战斗，击败奥弗罗后，女妖选择撤退。奥弗罗在临死前透露，艾索雷国王早已被怪物取代，并将宝石“维纳利斯”交还给了玛格莉忒公主。随后，安西姆向众人揭示了惊人的真相：“法鲁达”源于远古的魔神战争，当时主神米修拉为消灭恶魔，以整个羽人部族为代价发动了至高神力，极致的圣光在消灭魔龙的同时，也产生了与之相对的暗能量“法鲁达”，少量羽人外逃，战后米修拉将剩余的羽人与残存的“法鲁达”一同封印，而暗魔法师的目的，就是收集“法鲁达”和作为钥匙的“维纳利斯”，以复活魔龙。
真相大白后，艾克蒙德独自动身，追寻正在举行邪恶仪式的暗魔法师，途中得知了更为震撼的消息——暗魔法师竟声称自己是艾克蒙德的父亲。与此同时，玛格莉忒、克里格尔等人则前往北地三岛，寻找能对抗魔龙的神器“圣弓·玛鲁狄”，这是击败魔龙的关键道具。乘船前往北地三岛的途中，遭遇风暴，克里格尔不慎落水，被冲到艾尔斯岛岸边，被一名神秘女性救起，随后发现这名女性竟是自己早已死去、又被黑魔法复活的姐姐艾黎。艾黎坦白，她不愿与弟弟为敌，决定背叛暗魔法师，并指引众人前往遗忘之塔寻找圣弓·玛鲁狄。
众人抵达遗忘之塔后，在塔顶见到了圣弓·玛鲁狄，但被律神米拉拒绝授予。失望之际，异化后的凯尔薇丝琳（女妖）追杀而至，众人不敌惨败，危急时刻，艾黎发动禁忌魔法，与女妖同归于尽，克里格尔悲痛欲绝。众人事后在塔外发现了凯尔薇丝琳的首饰，才惊觉那被消灭的女妖正是她异化后的形态。众人悲痛之余，返回艾尔斯岛村长家，意外发现了圣弓·玛鲁狄，玛格莉忒将“维纳利斯”宝石与圣弓结合，成功解放了神器的力量，此时众人终于拥有了对抗魔龙的实力。
解放圣弓力量后，众人前往暗魔法师举行仪式的地点，与艾克蒙德汇合，此时暗魔法师的仪式已接近尾声，魔龙即将复活。众人联手与暗魔法师展开最终决战，击败暗魔法师后，魔龙成功复活，迎来游戏的最终BOSS战。战斗前，需做好充分准备，克里格尔可使用之前在66后院学到的RP技能“命运之击”（1/4的几率造成极大伤害，是唯一可以瞬杀最终BOSS的技能），依芙琳装备解锁真身的森罗云海（攻击力138，INT30点，属性优异），玛格莉忒装备圣弓·玛鲁狄，发挥神器的最大威力。最终BOSS战难度较高，需合理分配角色技能，及时补给血量，利用各角色的优势配合作战，击败魔龙后，即可完成主线剧情，解锁游戏结局。
补充主线流程中的关键要点，避免玩家错过重要内容：克里格尔的转职道具“信仰徽章”，需在教会捐献超过10000G后获得；玛格莉忒无需额外获取转职道具，15级以上且装备圣弓·玛鲁狄后，会自动触发转职剧情；依芙琳的转职道具“魔导士之袍”有3次获取机会，除了都樊镇帮小女孩写作业外，BOSS石魔像有15%几率掉落，麦狄亚大沙漠发掘也可获得；艾弗莱克的转职道具“圣者之书”，击败BOSS海龙后必定掉落。森罗云海的另一张封印解除咒文，在通向多利安东南面归隐者之塔的宝箱里，归隐者之塔的进入方法为：进入多利安之前的山洞，找到被石块堵住的岔路，剧情获得艾克蒙德家的返回之石后（艾弗莱克在队伍中），艾弗莱克会用炸药炸掉挡路的石头，进入后可让依芙琳学会武士刀的使用方法，才能装备森罗云海。EG地图“66后院”若错过精灵之森的进入机会，后期在造物者遗迹里找黑暗精灵对话也可进入，但有3分钟时间限制，建议在此期间全部购买经验之书，提升队伍等级。